spp что это в микробиологии
Что нужно знать о бактериальном вагинозе
Многие женщины сталкиваются с симптомами влагалищного дисбиоза. Обильные выделения, молочно-серого цвета и с неприятным запахом часто путают с «молочницей» и проводят «соответствующее» самолечение.
В большинстве случаев, такая стратегия быстрее навредит, чем поможет, поскольку причиной может быть бактериальный вагиноз (БВ).
Что такое баквагиноз
Согласно официальному определению, это невоспалительное заболевание влагалища, характеризующееся резким снижением или полным отсутствием лактофлоры и её заменой на анаэробные бактерии, среди которых наиболее распространены Gardnerella vaginalis (гарднерелла) и Atopobium vaginae (атопобиум).
У здоровых женщин репродуктивного возраста влагалищный микробиом на 95% представлен лактобактериями. Их способность к кислотообразованию (молочная кислота) и продукции перекиси водорода способствует поддержанию кислого pH и подавлению роста остальных микроорганизмов.
Оставшиеся 5% микрофлоры занимают более 300 видов аэробных и анаэробных микроорганизмов, среди которых:
Факторы риска и симптомы
Колонизация влагалища микрофлорой, связанной с баквагинозом, особенно Gardnerella vaginalis и Atopobium vaginae, сопровождается:
Отека и покраснения обычно не наблюдается, что является отличительным признаком от банального вагинита и кандидоза влагалища («молочницы»).
Диагностика
Самым простым, но косвенным, признаком нарушения влагалищной микрофлоры служит повышение pH >4,5. Для проведения такого «анализа» требуются всего лишь тест-полоски для измерения рН, доступные к покупке в любой аптеке. Однако, чтобы выявить возбудителя и начать адекватную терапию такой диагностики, конечно, недостаточно.
Современным и высокоточным методом диагностики влагалищных дисбиозов служит комплексное исследование «Флороценоз».
Этот тест разработан научными специалистами совместно с практикующими клиницистами. И предназначен для определения состава и соотношения нормальной и условно-патогенной флоры влагалища методом ПЦР.
Исследование представлено в 3-х вариантах для различных клинических ситуаций:
Название теста «говорит само за себя», а в результате будет отражено количество:
2. В случае, когда есть подозрения на нарушения более «широкого спектра», к применению рекомендован «Флороценоз», включающий подсчет:
3. При необходимости в дополнительной диагностике ИППП – подходит «Флороценоз – комплексное исследование», включающий в себя подсчет «классического состава» бактерий + выявление ДНК «виновников» ИППП:
Готовность анализов составляет 4-5 дней, а результат можно получить по электронной почте, в личном кабинете на сайте или в любом удобном отделении KDL.
Enterobacter spp. (качественный метод)
Описание исследования
Enterobacter spp. – это факультативные анаэробные* грамотрицательные бактерии, составляющие нормальную микрофлору кишечника. Они являются условно-патогенными, т.е. теми, которые при определенных условиях вызывают различные заболевания. Так, попадание Enterobacter spp. в другие органы становится причиной инфекционных заболеваний:
Среди прочих бактерий Enterobacter spp. наиболее часто вызывает внутрибольничные ангиогенных инфекций, инфекций мочевыводящих и дыхательных путей. Это обусловлено их повсеместным распространением и способностью обсеменять медицинское оборудование (в частности катетеры, вводимые в центральные вены), больничные предметы и мебель. По имеющимся данным на долю Enterobacter spp. приходится более 30% случаев развития сепсиса (заражения крови), более 65% случаев бактериального гастроэнтерита, не менее 75% случаев инфицирования мочевыводящих путей.
Данное исследование проводится методом полимеразной цепной реакции (ПЦР), позволяющим обнаружить специфические фрагменты ДНК Enterobacter spp. в тестируемых образцах биоматериала: урогенитальном соскобе, сперме, моче, соскобе буккального эпителия.
Аналитические показатели теста:
Факультативные анаэробные бактерии* – микроорганизмы, жизненный цикл которых может проходить как при отсутствии кислорода, так и при его присутствии. Этим они отличаются от облигатных анаэробов, которые при контакте с кислородом гибнут.
Подготовка к исследованию
Соскоб урогенитальный (цервикальный канал, влагалище, уретра)
Соскобы у женщин отбираются не ранее пятого дня от начала менструального цикла и не позже пятого дня до предполагаемой даты следующей менструации. Если наблюдаются явные признаки заболевания, отбор пробы проводится непосредственно в день обращения.
Требования по подготовке к тестированию:
Проба не отбирается:
При отборе эпителиальных клеток из мочеиспускательного канала, манипуляция проводится перед мочеиспусканием или через 1,5-2 часа после него.
Сперма
Отбор материала с целью диагностики проводится до начала противобактериального, антивирусного и противопаразитарного лечения, химиотерапии, а также до лечебных или диагностических мероприятий в месте предполагаемой локализации агента инфекции. После курса лечения проба отбирается не ранее, чем через 10-14 дней при проведении локальной терапии и через 30 дней после перорального приема антибиотиков.
На анализ собирается порция первой утренней мочи, выделенной не ранее, чем через 2-3 часа после предыдущего (ночного) мочеиспускания. Ее объем должен составлять порядка 20-30 мл. Емкость, используемая для сбора биоматериала – стерильный медицинский контейнер.
Моча собирается либо до проведения химиотерапии или лечения антибиотиками, либо через месяц после окончания курса лечения.
Перед началом манипуляции необходимо тщательно обмыть гениталии. Женщинам желательно воспользоваться гигиеническим тампоном во избежание попадания в пробу слизи из влагалища. Во время менструации материал не собирается.
После наполнения контейнера на треть-половину объема, емкость с мочой плотно закрывается крышкой, дабы избежать ее вытекания.
Доставка биоматериала должна быть организована в течение максимум 6 часов. До отправки в лабораторию моча может храниться как в холодильнике (при t⁰ от +2⁰С – замораживать ее нельзя), так и в комнате, но при этом температура не должна быть выше +25⁰С.
Соскоб буккального эпителия
Исследование проводится до проведения антибактериальной терапии.
Проба отбирается до приема пищи и проведения гигиенической обработки ротовой полости.
Соскоб берется медработником с внутренней поверхности щеки (буккального эпителия) или неба с помощью ворсинчатого зонда.
Показания к исследованию
Интерпретация исследования
Данный тест – качественный, результат выдается в формулировках «обнаружено» или «не обнаружено».
Нормой является отсутствие в исследуемой пробе специфических фрагментов ДНК Enterobacter spp.
Результат анализа выдается на бланке лаборатории медицинской компании «Наука». Пример результата по данному анализу представлен ниже:
Ф.И.О.: Иванов Иван Иванович Пол: м Год рождения: 01.01.0000
Дата исследования: 12.12.0000
Семейство Enterobacteriaceae. Часть 1
Автор: врач – клинический фармаколог Трубачева Е.С.
.jpg "spp что это в микробиологии. Смотреть фото spp что это в микробиологии. Смотреть картинку spp что это в микробиологии. Картинка про spp что это в микробиологии. Фото spp что это в микробиологии")
В ближайших статьях мы постараемся осветить все оставшееся семейство, как, во-первых, одно из самых проблемных в плане развития резистентности к антимикробным препаратам, а во-вторых — как возбудителей, наиболее часто являющихся причиной внутрибольничных инфекций.
Автор: врач – клинический фармаколог Трубачева Е.С.
Morganella spp. и Proteus spp.
Особо выдающихся представителей семейства Enterobacteriaceae мы уже разбирали в отдельных статьях, а именно представительницу рода Esherichia — кишечную палочку E.coli, а также одну из представительниц клебсиелл — Klebsiella pneumonia. В ближайших статьях мы постараемся осветить все оставшееся семейство, как, во-первых, одно из самых проблемных в плане развития резистентности к антимикробным препаратам, а во-вторых — как возбудителей, наиболее часто являющихся причиной внутрибольничных инфекций.
Микробиологические аспекты
Основными клинически значимыми представителями родов семейства Enterobacteriaceae, вызывающими заболевания у человека, являются:
Естественно совсем уж экзотику мы рассматривать не станем, но по наиболее часто встречающимся представителям обязательно пробежимся.
Клинические аспекты
Почему данное семейство так актуально? Наверное, потому, что почти ни одна нозология не обходится без его представителей. В самом широком смысле семейство Enterobacteriaceae является причиной следующих заболеваний:
Как мы видим, наши знакомые отметились практически везде. Но надо обязательно помнить, что выявление вышеуказанных представителей у здоровых людей из респираторного тракта, урогенитального и уж тем более желудочно-кишечного ни в коем случае не говорит о том, что человек чем-то болен, так как в большинстве своем эти микробы являются представителями нормальной микрофлоры, а не все люди умеют мыть руки, особенно летом.
Когда можно думать о наличии бактериальной патологии? Во-первых, когда имеется четкая клиника, во-вторых, когда микробы выделены из стерильных в норме сред, таких как кровь и ликвор, брюшная или плевральная полость, точнее, экссудат оттуда и, в-третьих, когда микроорганизмы выделены в клинически значимых концентрациях (тут в помощь будет ваша бак. лаборатория).
Стоит отметить еще один немаловажный момент — не все представители семейства Enterobacteriaceae умеют жить вне организма человека, и поэтому не размножаются во внешней среде, а потому обнаружение оных на пищевых продуктах и всевозможных поверхностях в лечебных учреждениях говорит о фекальном загрязнении, проще говоря, о неумении обрабатывать руки после посещения туалетной комнаты. Одним из таких микробов-детекторов является кишечная палочка, и стоит ее поймать даже не на руках персонала, а, например, на компьютерной мышке, как дальше можно уже ничего не искать, а начинать очередной этап избиения младенцев, пардон, обучения правилам асептики и антисептики, в частности, обработки рук.
Но давайте перейдем к частностям — и первым микроорганизмом, который будем сегодня рассматривать, станет:
Morganella spp.
Зверюшка названа так в честь своего первооткрывателя Гарри Р. Моргана.
Начнем традиционно с микробиологических аспектов
Семейство морганелл включает единственный вид M. morganii, включающий два подвида M. morganii и M. sibonii, которые различаются только ферментацией трегалозы.
Морганеллы являются представителями нормальной микрофлоры как человека, так и животных, а потому могут присутствовать в качестве сапрофитов в окружающей (внебольничной!) среде.
Морганеллы имеют довольно сложные отношения с антибактериальными препаратами и обладают природной резистентностью к:
Проявляют высокую чувствительность к:
Клинические аспекты
Как говорилось выше, морганеллы являются частью нормальной микрофлоры человека, крайне редко вызывая инфекционные заболевания. Чаще всего они являются возбудителями осложненных инфекций мочевыводящих путей.
Факторами риска развития инфекции являются:
В качестве механизмов резистентности морганеллы способны продуцировать бета-лактамазы, чем и объясняется их природная устойчивость к пенициллинам и цефалоспоринам 1-2 поколений. При нерациональном использовании антибиотиков они начинают вырабатывать бета-лактамазы расширенного спектра и факторы устойчивости к фторхинолонам, которыми довольно бодро делятся с соседями по семейству Enterobacteriaceae. Отдельно стоит отметить способность отдельных штаммов морганелл к резистентности к имипенему.
Какие заболевания вызывают чаще всего:
Терапевтические аспекты
Антибактериальная терапия будет полностью зависеть от результата из микробиологической лаборатории. Повторимся еще раз, микроб изначально умеет вырабатывать бета-лактамазы, а потому в случае развития осложненных инфекции мочевыводящих путей, которые чаще всего уже не связанны с кишечной палочкой, препаратами выбора становятся карбопенемы (имипенем, если штамм к нему чувствителен, или меропенем), дозирование которых проводится с учетом клиренса креатинина. Длительность лечения должна быть не менее 7 дней. В качестве альтернативы можно использовать цефалоспорин 4-го поколения Цефипим каждые 8 часов или фторхинолоны.
Аминогликозиды, несмотря на чувствительность к оным, при лечении заболеваний мочевыводящих путей лучше не применять в виду их нефро- и отоксичности, и по этой же причине их невозможно будет использовать около трех месяцев после проведенной терапии, например, в лечении синегнойной инфекции. Цефалоспорины третьего поколения тоже применять не стоит, так как морганеллы довольно быстро обзаводятся бета-лактамазами расширенного спектра, которые, как мы помним, эту генерацию препаратов быстро инактивируют.
Proteus spp.
Микробиологические аспекты
Протей долгое время был практически родным отцом морганеллы, так как последняя рассматривалась как один из видов рода протей. Этот род примечателен тем, что занимает почетное второе место по выявляемости после кишечной палочки в семействе Enterobacteriaceae.
В данный момент представителями рода протей являются P. mirabilis, вызывающий порядка 90% инфекционных заболеваний, а также P. vulgaris и P. penneri.
Клинические аспекты
Протеи выступают возбудителями порядка 10% неосложненных инфекций мочевыводящих путей, с чем могут быть связаны неудачи в лечении последних с использованием аминопенициллинов.
Как и все клинически значимые возбудители семейства Enterobacteriaceae, протей является возбудителем нозокомиальных инфекций, таких как пневмония, вплоть до сепсиса. Кроме того выступает возбудителем интраабдоминальных, а также хирургических инфекций кожи и мягких тканей, сепсиса, связанного с медицинскими вмешательствами как последствий нозокомиальной пневмонии в результате недостаточной дезинфекции, например, бронхоскопов.
Таким образом, мы видим, что, как и в предыдущем случае, проще правильно помыть руки и обработать инструменты, чем лечить это все с учетом природной и приобретенной резистентности.
Терапевтические аспекты
Как и в случае с морганеллой, нам просто необходим результат микробиологического исследования с определением чувствительности по МПК возбудителя либо результаты микробиологического мониторинга, которые помогут предположить зверей в случае неудачи ранее проводимого лечения.
В случае ампициллин-чувствительного P.mirabilis именно ампициллин может выступать препаратом первой линии. Кроме того, возможно использование цефуроксима и фторхинолонов. Обязательным аспектом лечения является его длительность. В случае неосложненных инфекций мочевыводящих путей (цистита) — не менее 3 дней, пиелонефрита — 10–14 дней, осложненных инфекций — 10–21 день. Сепсис является состоянием, требующим индивидуального подхода, но лечим не менее 14 дней.
На этом на сегодня мы закончим, но повторим одну базовую и, чего уж, наиважнейшую истину: в лечении инфекций, связанных с любым представителем семейства Enterobacteriaceae, самым главным будет являться профилактика. А именно правильное и тщательное мытье рук. Обеспечим мытье рук, не будет большинства проблем с инфекциями, вызванными указанным семейством.
Лечение урогенитальных инфекций
Записаться к врачу
+7 (812) 953-97-00
Урогенитальные инфекции ИППП – это бактерии и вирусы, которые при попадании в половые пути могут привести к неприятным симптомам, таким как: Урогенитальные инфекции
Возбудителями инфекционного процесса являются различные группы микроорганизмов, как патогенные — пагубно влияющие на организм, вызывающие опасные заболевания, так и условно — патогенные формы, которые вредят организму только в определенных условиях.
Заражение урогенитальными инфекциями происходит только половым путем: вагинальным, анальным, генитально-оральным. Таким образом урогенитальные инфекции могут быть обнаружены как во влагалище — у женщин, в мочеиспускательном канале — у мужчин, так и в прямой кишке и ротовой полости у обоих полов.
| Урогенитальные инфекции: | Опасность для организма и действия пациента: |
| ДНК Enterobacterium spp (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Энтеробактерии – кишечные бактерии – не являются ИППП. Вызывают воспалительные процессы в органах малого таза у мужчин и женщин. Может понадобиться профилактическое лечение у врача венеролога. |
| ДНК Streptococcus spp (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Стрептококк – грамоположительная бактерия обитает в кишечнике, носоглотке и урогенитальном тракте – не является ИППП. Повышенное количество может вызвать бактериальный вагиноз, эндометрит – у женщин, у мужчин – простатит, баланопостит, уретрит. Может понадобиться профилактическое лечение у врача венеролога. |
| ДНК Staphylococcus spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Стафилококк – грамположительная бактерия обитает в кишечнике, носоглотке и урогенитальном тракте – не является ИППП. Повышенное количество может вызывать дисбиоз, циститы, уретриты. Может понадобиться профилактическое лечение у врача венеролога. |
| ДНК Gardnerella vaginalis / Prevotella bivia / Porphyromonas spp. | Гарднереллез – микроаэрофильная влагалищная бактерия – не является ИППП. У мужчин может вызывать уретрит и баланопостит. У женщин вызывает бактериальный вагиноз, выделения с «рыбным» запахом. Требует лечения у врача венеролога. |
| ДНК Eubacterium spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Эубактериум – анаэробный микроорганизм обитающий в кишечнике – не является ИППП. При попадании в мочеполовой тракт может вызвать воспалительные процессы у мужчин и женщин. Может понадобиться профилактическое лечение у врача венеролога. |
| ДНК Sneathia spp./Leptotrihia spp./Fusobacterium spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Снетия / Лептотрихия / Фузобактериум – облигатно-анаэробные микроорганизмы – не являются ИППП. В большом количестве могут вызвать неприятные выделения из половых путей. Требуют лечения только при наличии жалоб. |
| ДНК Megasphaera spp./Veilonella spp./Dialister spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Мегасфера / Виелонелла / Диалистер –облигатно-анаэробные микроорганизмы, обитающие в кишечнике и ротовой полости – не являются ИППП. Требуют лечения у врача венеролога в профилактических целях и при наличии жалоб. |
| ДНК Lachnobacterium spp./Clostridium spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Лахнобактериум / Клостридии – облигатно-анаэробные микроорганизмы, обитающие в кишечнике – не являются ИППП. Могут приводить к воспалительным процессам мочеполового тракта. Требуют лечения у врача венеролога в профилактических целях и при наличии жалоб. |
| ДНК Mobiluncus spp./Corynebacterium spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Мобилункус / Корнибактериум – анаэробные микроорганизмы мочеполового тракта мужчин и женщин – не являются ИППП. При снижении иммунитета могут вызвать простатит, уретрит. Требуют лечения у врача венеролога в профилактических целях и при наличии жалоб. |
| ДНК Peptostreptococcus spp. (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Пептострептококус – анаэробная бактерия, обитает в ротовой полости, кишечнике, влагалище – не является ИППП. При наличии жалоб требует лечения у врача венеролога. |
| ДНК Atopobium vaginae (входит в показатель «общая бактериальная масса» в женском мазке) | Атопобиум – влагалищный облигатно-анаэробный микроорганизм – не является ИППП. У мужчин может вызывать уретрит и баланопостит, требует лечения у врача венеролога в профилактических целях. |
| ДНК Candida spp. | Кандида – дрожжеподобная грибковая инфекция, не является ИППП. При наличии жалоб требует лечения у врача венеролога. |
| ДНК Mycoplasma hominis | Микоплазма хоминес – условно-патогенный микроорганизм – ИППП, требует лечения у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
| ДНК Ureaplasma (urealyticu+parvum) | Уреаплазма уреалитикум + парвум – условно-патогенный микроорганизм – ИППП, требует лечения у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
| ДНК Neisseria gonorrhoeae | Гонококовая инфекция (гонорея) – особо опасная ИППП, требует экстренного лечения у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
| ДНК Chlamydia trachomatis | Хламидия (хламидиоз) – особо опасная ИППП, требует экстренного лечения у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
| ДНК Mycoplasma genitalium | Микоплазма гениталиум (микоплазмоз) – ИППП, требует экстренного лечения у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
| ДНК Trichomonas vaginalis | Трихомонада (трихомониаз) – особо опасная ИППП, требует экстренного лечения у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
| ДНК Herpes Simplex Virus 1,2 | Вирус генитального герпеса 1 и 2 типа – ИППП. Требуется лечение у врача венеролога, независимо от сопутствующей симптоматики. |
ВАЖНО!! УВАЖАЕМЫЕ ПАЦИЕНТЫ — УРОГЕНИТАЛЬНЫЕ (ПОЛОВЫЕ) ИНФЕКЦИИ НЕ ЛЕЧАТСЯ ОДНОЙ ВОЛШЕБНОЙ ТАБЛЕТКОЙ ИЛИ СВЕЧКОЙ ОТ ВСЕХ ИНФЕКЦИЙ, ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ КАЖДОЙ ИНФЕКЦИИ СУЩЕСТВУЕТ СВОЙ ПРЕПАРАТ, ДОЗИРОВКА КОТОРОГО НАЗНАЧАЕТСЯ ВРАЧОМ ИСХОДЯ ИЗ ДАВНОСТИ И СТЕПЕНИ ЗАРАЖЕНИЯ
ИППП — инфекции передающиеся половым путем требуют срочного лечения у врача венеролога. Самолечение сбивает симптоматику и переводит инфекцию в хроническую форму, которую в последствие трудно будет вылечить.
Условно — патогенные микроорганизмы — не так безобидны как могут казаться. При определенных факторах: стрессы, недосыпы, переутомляемость, снижение иммунитета — условно-патогенные микроорганизмы начинают усиленно размножаться и вызывать заболевания репродуктивных органов.
Урогенитальные инфекции последствия:
Профилактика урогенитальных инфекций урогенитальные инфекции
Для того, чтобы избежать присоединения инфекции следует соблюдать несложные правила: